TB：微流控技術(shù)在應(yīng)對耐藥性上的應(yīng)用（綜述）-Trends in Biotechnology

① 微流控技術(shù)可應(yīng)用于細(xì)菌性質(zhì)研究、細(xì)菌藥敏實(shí)驗(yàn)、培養(yǎng)“無法培養(yǎng)”的細(xì)菌以篩選新型抗生素等領(lǐng)域；

② 利用微流控技術(shù)研究細(xì)菌的抗生素耐藥性問題，具有縮減分析規(guī)模、局部環(huán)境精確控制、速度快、精度高、成本可控等優(yōu)勢；

③ 微流控技術(shù)存在缺陷包括：微流控器械所需的材料較難獲得、微流控環(huán)境可能對樣品內(nèi)的細(xì)菌有害等；

④ 在微流控技術(shù)領(lǐng)域研究進(jìn)展迅速的同時(shí)，其實(shí)際應(yīng)用轉(zhuǎn)化卻遲遲未達(dá)預(yù)期，仍需在商業(yè)化領(lǐng)域進(jìn)行更多的探索與嘗試。

Microfluidics for Combating Antimicrobial Resistance

2017-08-08  DOI: 10.1016/j.tibtech.2017.07.008

EP：冰川土壤、永久凍土及沉積物中的抗生素耐藥基因 - Environmental Pollution

① 利用宏基因組分析以下三種樣品中的抗生素耐藥基因（ARG）和可移動(dòng)遺傳元件（MGE）；

② 樣品包括：受人為活動(dòng)影響較小的冰川土壤、距今5821年的的深層永久凍土和珠江沉積物；

③ 沉積物中的ARG和MGE比冰川和永久凍土更豐富，其中的耐藥性機(jī)制類型也更多，磺胺類藥物，四環(huán)素類藥物和氟喹諾酮類藥物很常見；

④ 凍土中沒有發(fā)現(xiàn)磺胺類藥物和四環(huán)素類藥物，四環(huán)素在冰川土壤中也沒有發(fā)現(xiàn)；

⑤ MGE的多樣性與ARG的豐度和多樣性顯著相關(guān)。

Distribution of ARGs and MGEs among glacial soil, permafrost, and sediment using metagenomic analysis

2017-11-28  DOI: 10.1016/j.envpol.2017.11.031

Cell子刊：抗生素可不通過菌群削弱自身效果并改變宿主免疫功能 - Cell Host and Microbe

① 采用8周齡C57BL/6J小鼠，建立模型，腹膜大腸桿菌感染接受抗生素治療后，對宿主微環(huán)境中局部代謝產(chǎn)物的變化進(jìn)行分析；

② 抗生素治療可耗盡腹膜內(nèi)的中樞性代謝中產(chǎn)物，通過直接作用于宿主細(xì)胞，產(chǎn)生不依賴于菌群的局部代謝產(chǎn)物變化；

③ 治療過程中產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物如AMP，削弱抗生素療效，加強(qiáng)吞噬細(xì)胞的殺傷作用；

④ 抗生素自身可通過損傷線粒體、抑制免疫細(xì)胞的呼吸功能而干擾免疫功能，降低吞噬細(xì)胞的殺傷作用。

Antibiotic-Induced Changes to the Host Metabolic Environment Inhibit Drug Efficacy and Alter Immune Function

2017-11-30  DOI: 10.1016/j.chom.2017.10.020

SR：孕婦分娩期用抗生素，嬰兒菌群成熟推遲 - Scientific Reports

① 比較未接觸抗生素的順產(chǎn)嬰兒（53例）、分娩期接受抗生素預(yù)防（IAP）B型鏈球菌的嬰兒（14例）和剖腹產(chǎn)嬰兒（7例）的生命早期菌群演替；

② 對于IAP組順產(chǎn)孕婦的后代嬰兒，在出生后的12周內(nèi)，雙歧桿菌（在嬰兒腸道中占主導(dǎo)地位）擴(kuò)增延遲，并表現(xiàn)出埃希氏菌屬的持留；

③ IAP暴露的時(shí)間越長，對雙歧桿菌種群的影響程度越大，表明菌群成熟的延遲更長；

④ 剖腹產(chǎn)改變腸道定殖，包括擬桿菌門缺乏。

Intrapartum antibiotics for GBS prophylaxis alter colonization patterns in the early infant gut microbiome of low risk infants

2017-11-28  DOI: 10.1038/s41598-017-16606-9

Cell子刊：皮膚上常駐 vs 病原葡萄球菌的競爭模式 - Cell Host and Microbe

① 凝固酶陰性葡萄球菌（CoNS）和金黃色葡萄球菌是人類和其他哺乳動(dòng)物體內(nèi)天然菌群的一部分；

② 培養(yǎng)過CoNS菌種的山羊葡萄球菌的廢棄培養(yǎng)基，能夠抑制所有種類金黃色葡萄球菌引起的agr介導(dǎo)的群體感應(yīng)；

③ 山羊葡萄球菌自誘導(dǎo)信號(hào)肽（AIP）可能負(fù)責(zé)抑制群體感應(yīng)，AIP是一個(gè)八殘基的硫內(nèi)酯肽；

④ 在皮膚感染模型中，山羊葡萄球菌AIP減弱耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）誘導(dǎo)的壞死和負(fù)荷；

⑤ 在皮膚定殖和感染過程中，山羊葡萄球菌與MRSA直接競爭。

Coagulase-Negative Staphylococcal Strain Prevents Staphylococcus aureus Colonization and Skin Infection by Blocking Quorum Sensing

2017-11-30  DOI: 10.1016/j.chom.2017.11.001

AR：腸道菌群在多發(fā)性硬化中的作用（綜述） - Autoimmunity Reviews

① 共生菌群可引發(fā)自身免疫性髓鞘脫失，是多發(fā)性硬化（MS）的環(huán)境危險(xiǎn)因素；② 共生菌群在宿主體內(nèi)參與免疫系統(tǒng)調(diào)節(jié)，改變生物屏障的完整性和功能，并對中樞神經(jīng)系統(tǒng)產(chǎn)生影響；

③ 腸道微生態(tài)失調(diào)是MS的臨床特點(diǎn)之一，MS患者腸道中梭菌屬、擬桿菌門及其它具有免疫調(diào)節(jié)的細(xì)菌（例如Adlercreutzia）減少；

④ 因缺乏梭菌屬菌株產(chǎn)生的短鏈脂肪酸，MS患者體內(nèi)的Treg功能受到抑制；⑤ 調(diào)節(jié)共生菌群是一個(gè)有效的治療方向，有助于改善患者的臨床醫(yī)治結(jié)果。

Combined therapies to treat complex diseases: The role of the gut microbiota in multiple sclerosis

2017-11-27  DOI: 10.1016/j.autrev.2017.11.019

SR：利用培養(yǎng)過艱難梭菌的上清培養(yǎng)糞菌的結(jié)果 - Scientific Reports

① 挑選含有六種不同艱難梭菌的培養(yǎng)上清的2種條件培養(yǎng)基，用于培養(yǎng)糞便菌群，2種條件培養(yǎng)基中，菌群多樣性都顯著降低；

② 大多數(shù)的差異發(fā)生在厚壁菌門中，具有潛在保護(hù)功能的腸道共生菌（如乳桿菌屬、梭菌屬XIVa）減少，條件致病菌（如腸球菌屬）增加；

③ 兩種條件培養(yǎng)基中的細(xì)菌種群不同，可能與營養(yǎng)物的可利用性有關(guān)；

④ 含有大腸桿菌、腸炎沙門氏菌或表皮葡萄球菌的培養(yǎng)上清的條件培養(yǎng)基，培養(yǎng)的糞便菌群與艱難梭菌條件培養(yǎng)基中的明顯不同。

Evaluating the effect of Clostridium difficile conditioned medium on fecal microbiota community structure

2017-11-27  DOI: 10.1038/s41598-017-15434-1

GM：IBD患者腸道里富集的活潑瘤胃球菌 - Genome Medicine

① 對20名IBD患者和12名健康人的每月糞便樣品（266個(gè)）進(jìn)行宏基因組測序，發(fā)現(xiàn)患者體內(nèi)可耐受增加的腸道氧化應(yīng)激的兼性厭氧菌豐度明顯升高；

② IBD患者體內(nèi)的活潑瘤胃球菌大量增殖，且通常與疾病活動(dòng)度增加同時(shí)發(fā)生，鑒定出兩種金黃色葡萄球菌，其中一種在IBD患者體內(nèi)富集；

③ 對IBD患者體內(nèi)分離的9個(gè)菌株進(jìn)行測序，鑒定了199個(gè)參與氧化應(yīng)激反應(yīng)、粘附、鐵獲取及粘液利用的IBD特異性、菌株特異性基因；

④ 上述基因賦予活潑瘤胃球菌適應(yīng)性優(yōu)勢。

A novel Ruminococcus gnavus clade enriched in inflammatory bowel disease patients

2017-11-28  DOI: 10.1186/s13073-017-0490-5

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